Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rph3alQ768S4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rph3alQ768S4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rph3alQ768S4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rph3alQ768S4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Rph3alQ768S4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rph3alQ768S4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rph3alQ768S4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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