Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWY6

Ube2d2b, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2B, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d2bQ6ZWY6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2d2bQ6ZWY6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2d2bQ6ZWY6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms