Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl35Q6ZWV7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl35Q6ZWV7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms