Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ncapd3Q6ZQK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC30.39■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ncapd3Q6ZQK0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Ncapd3Q6ZQK0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ncapd3Q6ZQK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms