Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nemp1Q6ZQE4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nemp1Q6ZQE4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nemp1Q6ZQE4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms