Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Efr3bQ6ZQ18 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Efr3bQ6ZQ18 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Efr3bQ6ZQ18 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms