Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smg5Q6ZPY2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smg5Q6ZPY2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms