Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Znf653Q6YND2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Znf653Q6YND2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Znf653Q6YND2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms