Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cxcl3Q6W5C0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxcl3Q6W5C0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxcl3Q6W5C0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms