Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Timd4Q6U7R4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Timd4Q6U7R4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Timd4Q6U7R4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms