Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bnip1Q6QD59 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Bnip1Q6QD59 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Bnip1Q6QD59 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms