Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q477

Atp2b4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b4Q6Q477 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2b4Q6Q477 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atp2b4Q6Q477 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2b4Q6Q477 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms