Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nudcd1Q6PIP5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nudcd1Q6PIP5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nudcd1Q6PIP5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms