Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ8

Kcnip4, Kv channel-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip4Q6PHZ8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Kcnip4Q6PHZ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnip4Q6PHZ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms