Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gramd2bQ6PEM6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gramd2bQ6PEM6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms