Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE54

Dhx40, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx40Q6PE54 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Dhx40Q6PE54 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Dhx40Q6PE54 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dhx40Q6PE54 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms