Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc36Q6PDM4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc36Q6PDM4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms