Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDG5

Smarcc2, SWI/SNF complex subunit SMARCC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc2Q6PDG5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcc2Q6PDG5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcc2Q6PDG5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcc2Q6PDG5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms