Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak1Q6PD31 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak1Q6PD31 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak1Q6PD31 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms