Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAJ3

Garem2, GRB2-associated and regulator of MAPK protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem2Q6PAJ3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Garem2Q6PAJ3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Garem2Q6PAJ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Garem2Q6PAJ3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms