Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slf2Q6P9P0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Slf2Q6P9P0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slf2Q6P9P0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms