Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc148Q6P5U8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc148Q6P5U8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc148Q6P5U8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms