Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Frg2f1Q6P3A2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Frg2f1Q6P3A2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Frg2f1Q6P3A2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms