Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Paxip1Q6NZQ4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Paxip1Q6NZQ4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Paxip1Q6NZQ4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms