Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fndc3bQ6NWW9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fndc3bQ6NWW9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms