Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Colgalt2Q6NVG7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Colgalt2Q6NVG7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Colgalt2Q6NVG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms