Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
U2surpQ6NV83 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
U2surpQ6NV83 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms