Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cep78Q6IRU7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cep78Q6IRU7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cep78Q6IRU7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms