Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpm4Q6IRU2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpm4Q6IRU2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpm4Q6IRU2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms