Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Krt39Q6IFX4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Krt39Q6IFX4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Krt39Q6IFX4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 514.8 ms