Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE28

Gm5416, Predicted gene 5416, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5416Q6IE28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm5416Q6IE28 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm5416Q6IE28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms