Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp7Q6A4J8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp7Q6A4J8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Usp7Q6A4J8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Usp7Q6A4J8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Usp7Q6A4J8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Usp7Q6A4J8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Usp7Q6A4J8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Usp7Q6A4J8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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Usp7Q6A4J8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Usp7Q6A4J8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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Usp7Q6A4J8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp7Q6A4J8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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