Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sptbn2Q68FG2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sptbn2Q68FG2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms