Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CltcQ68FD5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CltcQ68FD5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CltcQ68FD5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CltcQ68FD5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms