Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Nlrp9bQ66X22 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nlrp9bQ66X22 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nlrp9bQ66X22 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms