Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnna3Q65CL1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna3Q65CL1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna3Q65CL1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms