Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtprdQ64487 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PtprdQ64487 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PtprdQ64487 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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PtprdQ64487 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PtprdQ64487 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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