Protein–RNA interactions for Protein: Q64253

Ly6e, Lymphocyte antigen 6E, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6eQ64253 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ly6eQ64253 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ly6eQ64253 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms