Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pan3Q640Q5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pan3Q640Q5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms