Protein–RNA interactions for Protein: Q640N2

Arl13b, ADP-ribosylation factor-like protein 13B, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13bQ640N2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arl13bQ640N2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arl13bQ640N2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl13bQ640N2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl13bQ640N2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl13bQ640N2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arl13bQ640N2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arl13bQ640N2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms