Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga3Q62470 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga3Q62470 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga3Q62470 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms