Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vil1Q62468 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vil1Q62468 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms