Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxa13Q62424 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Hoxa13Q62424 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms