Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Epha6Q62413 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Epha6Q62413 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms