Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tff3Q62395 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tff3Q62395 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms