Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Supt6hQ62383 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Supt6hQ62383 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Supt6hQ62383 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Supt6hQ62383 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms