Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TrhQ62361 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TrhQ62361 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TrhQ62361 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms