Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Taf6Q62311 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf6Q62311 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms