Protein–RNA interactions for Protein: Q62283

Tspan7, Tetraspanin-7, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan7Q62283 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tspan7Q62283 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tspan7Q62283 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tspan7Q62283 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms