Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Sall3Q62255 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Sall3Q62255 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Sall3Q62255 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms